SREBF1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1AM9

Ідентифікатори

Символи

SREBF1, SREBP-1c, SREBP1, bHLHd1, SREBP1a, sterol regulatory element binding transcription factor 1

Зовнішні ІД

OMIM: 184756 MGI: 107606 HomoloGene: 3079 GeneCards: SREBF1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sterol response element binding • chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0010577 enzyme activator activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • integral component of membrane • гіалоплазма • комплекс Ґольджі • nuclear envelope • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • Golgi membrane • нуклеоплазма • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• positive regulation of histone deacetylation • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • positive regulation of triglyceride biosynthetic process • steroid metabolic process • negative regulation of insulin secretion • response to fatty acid • lipid biosynthetic process • response to glucagon • regulation of protein stability • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to retinoic acid • GO:1904578 response to organic cyclic compound • lung development • lipid metabolism • regulation of insulin secretion • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to starvation • response to progesterone • GO:0010260 старіння людини • response to peptide hormone • mRNA transcription by RNA polymerase II • cholesterol metabolic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • response to glucose • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • response to lipid • cellular response to fatty acid • regulation of autophagy of mitochondrion • regulation of protein targeting to mitochondrion • regulation of fatty acid metabolic process • циркадний ритм • cellular response to insulin stimulus • response to food • positive regulation of cholesterol biosynthetic process • response to cAMP • regulation of heart rate by chemical signal • fat cell differentiation • intracellular receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of cholesterol biosynthetic process • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6720


20787

Ensembl


ENSG00000072310


ENSMUSG00000020538

UniProt


P36956


Q9WTN3

RefSeq (мРНК)


NM_001005291 NM_004176 NM_001321096


NM_011480 NM_001313979 NM_001358314 NM_001358315

RefSeq (білок)


NP_001005291 NP_001308025 NP_004167


NP_001300908 NP_035610 NP_001345243 NP_001345244

Локус (UCSC)

Хр. 17: 17.81 – 17.84 Mb

Хр. 11: 60.09 – 60.11 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

SREBF1 (англ. Sterol regulatory element binding transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 147 амінокислот, а молекулярна маса — 121 675^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDEPPFSEAA	LEQALGEPCD	LDAALLTDIE	DMLQLINNQD	SDFPGLFDPP
YAGSGAGGTD	PASPDTSSPG	SLSPPPATLS	SSLEAFLSGP	QAAPSPLSPP
QPAPTPLKMY	PSMPAFSPGP	GIKEESVPLS	ILQTPTPQPL	PGALLPQSFP
APAPPQFSST	PVLGYPSPPG	GFSTGSPPGN	TQQPLPGLPL	ASPPGVPPVS
LHTQVQSVVP	QQLLTVTAAP	TAAPVTTTVT	SQIQQVPVLL	QPHFIKADSL
LLTAMKTDGA	TVKAAGLSPL	VSGTTVQTGP	LPTLVSGGTI	LATVPLVVDA
EKLPINRLAA	GSKAPASAQS	RGEKRTAHNA	IEKRYRSSIN	DKIIELKDLV
VGTEAKLNKS	AVLRKAIDYI	RFLQHSNQKL	KQENLSLRTA	VHKSKSLKDL
VSACGSGGNT	DVLMEGVKTE	VEDTLTPPPS	DAGSPFQSSP	LSLGSRGSGS
GGSGSDSEPD	SPVFEDSKAK	PEQRPSLHSR	GMLDRSRLAL	CTLVFLCLSC
NPLASLLGAR	GLPSPSDTTS	VYHSPGRNVL	GTESRDGPGW	AQWLLPPVVW
LLNGLLVLVS	LVLLFVYGEP	VTRPHSGPAV	YFWRHRKQAD	LDLARGDFAQ
AAQQLWLALR	ALGRPLPTSH	LDLACSLLWN	LIRHLLQRLW	VGRWLAGRAG
GLQQDCALRV	DASASARDAA	LVYHKLHQLH	TMGKHTGGHL	TATNLALSAL
NLAECAGDAV	SVATLAEIYV	AAALRVKTSL	PRALHFLTRF	FLSSARQACL
AQSGSVPPAM	QWLCHPVGHR	FFVDGDWSVL	STPWESLYSL	AGNPVDPLAQ
VTQLFREHLL	ERALNCVTQP	NPSPGSADGD	KEFSDALGYL	QLLNSCSDAA
GAPAYSFSIS	SSMATTTGVD	PVAKWWASLT	AVVIHWLRRD	EEAAERLCPL
VEHLPRVLQE	SERPLPRAAL	HSFKAARALL	GCAKAESGPA	SLTICEKASG
YLQDSLATTP	ASSSIDKAVQ	LFLCDLLLVV	RTSLWRQQQP	PAPAPAAQGT
SSRPQASALE	LRGFQRDLSS	LRRLAQSFRP	AMRRVFLHEA	TARLMAGASP
TRTHQLLDRS	LRRRAGPGGK	GGAVAELEPR	PTRREHAEAL	LLASCYLPPG
FLSAPGQRVG	MLAEAARTLE	KLGDRRLLHD	CQQMLMRLGG	GTTVTSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

Hua X., Wu J., Goldstein J.L., Brown M.S., Hobbs H.H. (1995). Structure of the human gene encoding sterol regulatory element binding protein-1 (SREBF1) and localization of SREBF1 and SREBF2 to chromosomes 17p11.2 and 22q13. Genomics. 25: 667—673. PMID 7759101 DOI:10.1016/0888-7543(95)80009-B
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hua X., Sakai J., Brown M.S., Goldstein J.L. (1996). Regulated cleavage of sterol regulatory element binding proteins requires sequences on both sides of the endoplasmic reticulum membrane. J. Biol. Chem. 271: 10379—10384. PMID 8626610 DOI:10.1074/jbc.271.17.10379
Parraga A., Bellsolell L., Ferre-D'Amare A.R., Burley S.K. (1998). Co-crystal structure of sterol regulatory element binding protein 1a at 2.3-A resolution. Structure. 6: 661—672. PMID 9634703 DOI:10.1016/S0969-2126(98)00067-7

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11289 (англ.) . Архів оригіналу за 20 жовтня 2018. Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P36956 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори

(1) Основні домени

(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)	Фактори актривації транскрипції AATF 1 2 3 4 5 6 7 AP-1 c-Fos FOSB FOSL1 FOSL2 JDP2 c-Jun JUNB JUND BACH 1 2 BATF BLZF1 C/EBP α β γ δ ε ζ CREB 1 3 L1 CREM DBP DDIT3 GABPA GCN4 HLF MAF B F G K NFE 2 L1 L2 L3 NFIL3 NRL NRF 1 2 3 XBP1

(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)	ATOH1 AHR AHRR ARNT ASCL1 BHLH 2 3 9 ARNTL ARNTL ARNTL2 CLOCK EPAS1 FIGLA HAND 1 2 HES 5 6 HEY 1 2 L HES1 HIF 1A 3A ID 1 2 3 4 LYL1 MESP2 MXD4 MYCL MYCN Міогенні фактори MyoD MYOG MYF5 MYF6 Нейрогеніни 1 2 3 НейроD 1 2 NPAS 1 2 3 OLIG 1 2 SIM 1 2 TAL 1 2 TWIST1 USF1

(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)	AP-4 MAX MXD1 MXD3 MITF MNT MLX MLXIPL MXI1 Myc SREBP 1 2

(1.4) NF-1	NFI A B C X SMAD R-SMAD 1 2 3 5 9 I-SMAD 6 7 4)

(1.5) RF-X	RFX 1 2 3 4 5 6 ANK

(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)	AP-2 α β γ δ ε

(2) Цинк-координовані домени ДНК

(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys₄)

підродина 1	Тиреоїдний гормон α β CAR FXR LXR α β PPAR α β/δ γ PXR RAR α β γ ROR α β γ Rev-ErbA α β VDR

підродина 2	COUP-TF I II Ear-2 HNF4 α γ PNR RXR α β γ Тестикулярні рецептори 2 4 TLX

підродина 3	Стероїдні гормони Андроген Естроген α β Глюкокортикоїди Мінералокортикоїди Прогестерон Естроген-зв'язувальні α β γ

підродина 4	NUR NGFIB NOR1 NURR1

підродина 5	LRH-1 SF1

підродина 6	GCNF

підродина 0	DAX1 SHP

(2.2) Інші цинкові пальці Cys₄

GATA
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
MTA
- 1
- 2
- 3
TRPS1

(2.3) Cys₂His₂ з доменом цинкових пальців

Загальні фактори транскрипції
- TFIIA
  - 1
  - 2
- TFIIB
- TFIID
  - TBP
    - L1
    - L2
  - TAF
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 4B
    - 5
    - 6
    - 7
    - 8
    - 9
    - 9B
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 15
- TFIIE
  - 1
  - 2
- TFIIF
  - 1
  - 2
- TFIIH
  - 1
  - 2
  - 4
  - 2I
  - 3A
  - 3C1
  - 3C2

ATBF1
BCL
- 1
- 2
- 3
- 5
- 6
- 6B
- 7A
- 7B
- 7C
- 8
- 9
- 10
- 11A
- 11B
CTCF
E4F1
EGR
- 1
- 2
- 3
- 4
ERV3
GFI1
GLI
- 1
- 2
- 3
- REST
- S1
- S2
- YY1
HIC
- 1
- 2
HIVEP
- 1
- 2
- 3
IKZF
- 1
- 2
- 3
ILF
- 2
- 3
KLF
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
- 6
- 7
- 8
- 9
- 10
- 11
- 12
- 13
- 14
- 15
- 17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
SALL
- 1
- 2
- 3
- 4
SP
- 1
- 2
- 4
- 7
- 8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
- 7A
- 7B
ZBTB
- 11
- 16
- 17
- 20
- 32
- 33
- 40
цинкові пальці
- 3
- 7
- 9
- 10
- 19
- 22
- 24
- 33B
- 34
- 35
- 41
- 43
- 44
- 51
- 74
- 143
- 146
- 148
- 165
- 202
- 217
- 219
- 238
- 239
- 259
- 267
- 268
- 281
- 295
- 300
- 318
- 330
- 346
- 350
- 365
- 366
- 384
- 423
- 451
- 452
- 471
- 593
- 638
- 644
- 649
- 655

(2.4) Cys₆ цистеїн-цинковий кластер

HIVEP1

(2.5) Цинкові пальці іншого складу

AIRE
DIDO1
GRLF1
ING
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
JARID
- 1A
- 1B
- 1C
- 1D
- 2
JMJD1B

(2.6) WRKY

WRKY

(3) Домени спіраль-поворот-спіраль

(3.1) Гомеобокс	ARX CDX 1 2 CRX CUTL1 DBX 1 2 DLX 1 2 3 4 5 6 EMX 1 2 EN 1 2 FHL 1 2 3 HESX1 HHEX HLX Гомеобокс A1 A2 A3 A4 A5 A7 A9 A10 A11 A13 B1 B2 B3 B4 B5 B6 B7 B8 B9 B13 C4 C5 C6 C8 C9 C10 C11 C12 C13 D1 D3 D4 D8 D9 D10 D11 D12 D13 HOPX IRX 1 2 3 4 5 6 MKX LMX 1A 1B MEIS 1 2 MEOX2 MNX1 MSX 1 2 NANOG NKX 2-1 2-2 2-3 2-5 3-1 3-2 6-1 6-2 NOBOX PBX 1 2 3 PHF 1 3 6 8 10 16 17 20 21A PHOX 2A 2B PITX 1 2 3 POU PIT-1 BRN-3 A B C Oct 1 2 3/4 6 7 11 OTX 1 2 PDX1 SATB2 SHOX2 SIX 1 2 3 4 5 VAX1 ZEB 1 2

(3.2) Парний бокс	PAX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 PRRX 1 2 RAX

(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль	E2F 1 2 3 4 5 FOX A1 A2 A3 C1 C2 D3 D4 E1 E3 F1 G1 H1 I1 J1 J2 K1 K2 L2 M1 N1 N3 O1 O3 O4 P1 P2 P3 P4

(3.4) Фактори теплового шоку	HSF 1 2 4

(3.5) Триптофановий кластер	ELF 2 4 5 EHF ELK 1 3 4 ERF ETS 1 2 ERG SPIB ETV 1 2 3 4 5 6 FLI1 IRF 1 2 3 4 5 6 7 8 MYB MYBL2

(3.6) Домен транскрипційний енхансер	TEA 1 2 3 4

(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом

(4.1) RHR	NF-κB NFKB1 NFKB2 REL RELA RELB NFAT C1 C2 C3 C4 5

(4.2) STAT	STAT^[en] 1 2 3 4 5 A B 6

(4.3) p53	p53 TBX 1 2 3 5 19 21 22 TBR1 TBR2 TFT MYRF TP63

(4.4) MADS	Mef2 A B C D SRF

(4.6) TATA	TBP TBPL1

(4.7) Високомобільна група	BBX HMGB 1 2 3 4 HMGN 1 2 3 4 HNF 1A 1B LEF1 SOX 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 17 18 21 30 SRY SSRP1 TCF 3 4 TOX 1 2 3 4

(4.9) Grainyhead	TFCP2

(4.10) Домен холодового шоку	CSDA YBX1

(4.11) Runt	CBF CBFA2T2 CBFA2T3 RUNX1 RUNX2 RUNX3 RUNX1T1

(0) Інші фактори транскрипції

(0.2) HMGI(Y)	HMGA 1 2 HBP1

(0.3) Pocket домен	Rb RBL1 RBL2

(0.5) AP2/EREBP-подібні	AP2 EREBP B3

(0.6) Інші	ARID 1A 1B 2 3A 3B 4A CAP IFI 16 35 MLL 2 3 T1 MNDA NFY A B C Ро/Сигма