CNOT1

CNOT1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

4C0D, 4CQO, 4CRV, 4CRW, 4CT4, 4CT6, 4CT7, 4GMJ, 4GML, 4J8S, 5ANR, 5FU6, 5FU7

معرفات
أسماء بديلة CNOT1, CDC39, NOT1, NOT1H, AD-005, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, HPE12, VIBOS
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604917 MGI: MGI:2442402 HomoloGene: 9453 GeneCards: 23019
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• poly(A)-specific ribonuclease activity
• protein domain specific binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• retinoic acid receptor binding
• armadillo repeat domain binding
• ‏GO:0032947 molecular adaptor activity
• estrogen receptor binding
• RNA binding

مكونات خلوية

• غشاء
• CCR4-NOT complex
• peroxisomal membrane
• أجسام P
• CCR4-NOT core complex
• نواة
• خارج خلوي
• سيتوبلازم
• عصارة خلوية

عمليات حيوية

• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
• negative regulation of translation
• positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening
• ‏GO:0009373 ضبط نسخ الدنا
• negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway
• regulation of stem cell population maintenance
• ‏GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• positive regulation of mRNA catabolic process
• نسخ الدنا
• نمو متعدد الخلايا
• positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly
• positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay
• gene silencing by miRNA
• إسكات الجين
• negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
• regulation of translation
• RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic
• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 23019 234594
Ensembl ENSG00000125107 ENSMUSG00000036550
يونيبروت

A5YKK6
H3BNB1

Q6ZQ08

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001265612، ‏NM_016284، ‏NM_206999 NR_049763، ‏NM_001265612، ‏NM_016284، ‏NM_206999

‏NM_153164، ‏NM_178078، ‏XM_006530870، ‏XM_006530871، ‏XM_006530872، ‏XR_001778431، ‏XR_003947260، ‏NM_001372351، ‏NM_001372353، ‏XM_036153964، ‏XM_036153965 NM_001205226، ‏NM_153164، ‏NM_178078، ‏XM_006530870، ‏XM_006530871، ‏XM_006530872، ‏XR_001778431، ‏XR_003947260، ‏NM_001372351، ‏NM_001372353، ‏XM_036153964، ‏XM_036153965

RefSeq (بروتين)

‏NP_057368، ‏NP_996882 NP_001252541، ‏NP_057368، ‏NP_996882

‏NP_694804، ‏NP_835179، ‏XP_006530933، ‏XP_006530934، ‏XP_006530935، ‏NP_001359280، ‏NP_001359282، ‏XP_036009857، ‏XP_036009858 NP_001192155، ‏NP_694804، ‏NP_835179، ‏XP_006530933، ‏XP_006530934، ‏XP_006530935، ‏NP_001359280، ‏NP_001359282، ‏XP_036009857، ‏XP_036009858

الموقع (UCSC n/a Chr 8: 96.45 – 96.53 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

CNOT1‏ (CCR4-NOT transcription complex subunit 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين CNOT1 في الإنسان.[1][2][3][4][5][6]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ "Entrez Gene: CNOT1 CCR4-NOT transcription complex, subunit 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  2. ^ Sandler H، Kreth J، Timmers HT، Stoecklin G (مايو 2011). "Not1 mediates recruitment of the deadenylase Caf1 to mRNAs targeted for degradation by tristetraprolin". Nucleic Acids Res. ج. 39 ع. 10: 4373–86. DOI:10.1093/nar/gkr011. PMC:3105394. PMID:21278420.
  3. ^ Garneau NL، Wilusz J، Wilusz CJ (فبراير 2007). "The highways and byways of mRNA decay". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. ج. 8 ع. 2: 113–26. DOI:10.1038/nrm2104. PMID:17245413.
  4. ^ Petit AP، Wohlbold L، Bawankar P، Huntzinger E، Schmidt S، Izaurralde E، Weichenrieder O (نوفمبر 2012). "The structural basis for the interaction between the CAF1 nuclease and the NOT1 scaffold of the human CCR4-NOT deadenylase complex". Nucleic Acids Res. ج. 40 ع. 21: 11058–72. DOI:10.1093/nar/gks883. PMC:3510486. PMID:22977175.
  5. ^ Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، Otsuki T، Sugiyama T، Irie R، وآخرون (يناير 2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nature Genetics. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
  6. ^ Basquin J، Roudko VV، Rode M، Basquin C، Séraphin B، Conti E (26 أكتوبر 2012). "Architecture of the nuclease module of the yeast Ccr4-not complex: the Not1-Caf1-Ccr4 interaction". Mol. Cell. ج. 48 ع. 2: 207–18. DOI:10.1016/j.molcel.2012.08.014. PMID:22959269.

قراءة متعمقة

  • Bonaldo MF، Lennon G، Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. ج. 6 ع. 9: 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID:8889548.
  • Nagase T، Ishikawa K، Suyama M، Kikuno R، Hirosawa M، Miyajima N، Tanaka A، Kotani H، Nomura N، Ohara O (1999). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Res. ج. 6 ع. 1: 63–70. DOI:10.1093/dnares/6.1.63. PMID:10231032.
  • Chen J، Rappsilber J، Chiang YC، Russell P، Mann M، Denis CL (2001). "Purification and characterization of the 1.0 MDa CCR4-NOT complex identifies two novel components of the complex". J. Mol. Biol. ج. 314 ع. 4: 683–94. DOI:10.1006/jmbi.2001.5162. PMID:11733989.
  • Laveder P، De Pittà C، Toppo S، Valle G، Lanfranchi G (2002). "A two-step strategy for constructing specifically self-subtracted cDNA libraries". Nucleic Acids Res. ج. 30 ع. 9: e38. DOI:10.1093/nar/30.9.e38. PMC:113861. PMID:11972353.
  • Winkler GS، Mulder KW، Bardwell VJ، Kalkhoven E، Timmers HT (2006). "Human Ccr4-Not complex is a ligand-dependent repressor of nuclear receptor-mediated transcription". EMBO J. ج. 25 ع. 13: 3089–99. DOI:10.1038/sj.emboj.7601194. PMC:1500986. PMID:16778766.
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 16
جينات الكروموسوم 16
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 16 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية