CELSR3

edit
Kadherin, EGF LAG sedmoprolazani G-tip receptor 3 (flamingo homolog, Drozofila)
Identifikatori
SimboliCELSR3; CDHF11; EGFL1; FMI1; HFMI1; MEGF2; RESDA1
Vanjski IDOMIM: 604264 MGI: 1858236 HomoloGene: 1077 IUPHAR: CELSR3 GeneCards: CELSR3 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija • aktivnost G protein spregnutog receptora
• proteinsko vezivanje
Celularna komponenta • integralno sa ćelijskom membranom
• integralno sa membranom
• membranska frakcija
Biološki proces • signalni put G protein spregnutog receptora
• neuronska migracija
• regulacija transkripcije, DNK-zavisna
• homofilna ćelijska adhezija
• neuropeptidni signalni put
Ortolozi
VrstaČovekMiš
Entrez1951107934
EnsemblENSG00000008300ENSMUSG00000023473
UniProtQ9NYQ7Q91ZI0
RefSeq (mRNA)NM_001407.2NM_080437.2
RefSeq (protein)NP_001398.2NP_536685.2
Lokacija (UCSC)Chr 3:
48.67 - 48.7 Mb		Chr 9:
108.73 - 108.76 Mb
PubMed pretraga[1][2]

Kadherin EGF LAG sedmoprolazni G-tip receptor 3 je protein koji je kod ljudi kodiran CELSR3 genom.[1][2]

Ovaj protein je član flamingo familije, koja pripada kadherinskoj superfamiliji. Flamingo familija se sastoji od neklasičnog tipa kadherina. Ta grupa ne formira interakcije sa kateninima. Flamingo kadherini su locirani u ćelijskoj membrani i imaju devet kadherinskih domena, sedam epidermalnom faktoru rasta sličnih ponavljanja i dva laminin A G-tip ponavljanja u njihovom ektodomenu. Oni takođe imaju sedam transmembranskih domena, koji su karakteristični za ovu potfamiliju. Smatra se da su ovi proteini receptori koji učestvuju u kontaktom posredovanoj komunikaciji. Kadherinski domeni deluju kao homofilni vezujući regioni i EGF-slični domeni koji učestvuju u ćelijskoj adheziji i receptor-ligand interakcijama. CELSR1 ima nepoznatu ulogu.[2]

Reference

  1. ↑ Nakayama M, Nakajima D, Nagase T, Nomura N, Seki N, Ohara O (Sep 1998). „Identification of high-molecular-weight proteins with multiple EGF-like motifs by motif-trap screening”. Genomics 51 (1): 27–34. DOI:10.1006/geno.1998.5341. PMID 9693030. 
  2. ↑ 2,0 2,1 „Entrez Gene: CELSR3 cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 (flamingo homolog, Drosophila)”. 

Literatura

  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery”. Genome Res. 6 (9): 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548. 
  • Wu Q, Maniatis T (1999). „A striking organization of a large family of human neural cadherin-like cell adhesion genes”. Cell 97 (6): 779–90. DOI:10.1016/S0092-8674(00)80789-8. PMID 10380929. 
  • Wu Q, Maniatis T (2000). „Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3124–9. DOI:10.1073/pnas.060027397. PMC 16203. PMID 10716726. 
  • Formstone CJ, Barclay J, Rees M, Little PF (2000). „Chromosomal localization of Celsr2 and Celsr3 in the mouse; Celsr3 is a candidate for the tippy (tip) lethal mutant on chromosome 9”. Mamm. Genome 11 (5): 392–4. DOI:10.1007/s003350010073. PMID 10790539. 
  • Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Protein–Protein Interactions Between Large Proteins: Two-Hybrid Screening Using a Functionally Classified Library Composed of Long cDNAs”. Genome Res. 12 (11): 1773–84. DOI:10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765. 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). „Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932. 
  • Bjarnadóttir TK, Fredriksson R, Höglund PJ, et al. (2005). „The human and mouse repertoire of the adhesion family of G-protein-coupled receptors”. Genomics 84 (1): 23–33. DOI:10.1016/j.ygeno.2003.12.004. PMID 15203201. 

Vidi još

  • Flamingo (protein)
  • p
  • r
  • u
Klasa A: Rodopsinu slični
α1 (A, B, D) • α2 (A, B, C) • β1 • β2 • β3
Adenozinski (A1, A2A, A2B, A3) • P2Y (1, 2, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14)
(svi osim 5-HT3) 5-HT1 (A, B, D, E, F) • 5-HT2 (A, B, C) • 5-HT (4, 5A, 6, 7)
Drugi
Acetilholin (M1, M2, M3, M4, M5) • Dopamin (D1, D2, D3, D4, D5) • Histamin (H1, H2, H3, H4) • Melatonin (1A, 1B, 1C) • TAAR (1, 2, 3, 5, 6, 8, 9)
Metaboliti i
signalni molekuli
CysLT (1, 2) • LTB4 (1, 2) • FPRL1 • OXE • Prostaglandin (DP (1, 2), EP (1, 2, 3, 4), FP) • Prostaciklin • Tromboksan
Drugi
Žučna kiselina • Kanabinoidni (CB1, CB2, GPR (18, 55, 119)) • EBI2 • Estrogen • Slobodna masna kiselina (1, 2, 3, 4) • Laktat  • Lizofosfatidna kiselina (1, 2, 3, 4, 5, 6)  • Lizofosfolipid (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8) • Niacin (1, 2) • Oksoglutarat • PAF • Sfingozin-1-fosfat (1, 2, 3, 4, 5) • Sukcinat
Peptid
B/W (1, 2) • FF (1, 2) • S • Y (1, 2, 4, 5) • Neuromedin (B, U (1, 2)) • Neurotenzin (1, 2)
Drugi
Anafilatoksin (C3a, C5a) • Angiotenzin (1, 2) • Apelin • Bombezin (BRS3, GRPR, NMBR) • Bradikinin (B1, B2) • Hemokin • Holecistokinin (A, B) • Endotelin (A, B) • Formil peptid (1, 2, 3) • FSH • Galanin (1, 2, 3) • GHB receptor • Gonadotropin-oslobađajući hormon (1, 2) • Grelin • Kispeptin • Luteinizirajući hormon/horiogonadotropin • MAS (1, 1L, D, E, F, G, X1, X2, X3, X4) • Melanokortin (1, 2, 3, 4, 5) • MCHR (1, 2) • Motilin • Opioidni (δ, κ, μ, Nociceptin & ζ, ali ne σ) • Oreksin (1, 2) • Oksitocin • Prokineticin (1, 2) • Prolaktin-oslobađajući peptid • Relaksin (1, 2, 3, 4) • Somatostatin (1, 2, 3, 4, 5) • Tahikinin (1, 2, 3) • Tirotropin • Tirotropin-oslobađajući hormon • Urotenzin-II • Vazopresin (1A, 1B, 2)
Razno
GPR (1, 3, 4, 6, 12, 15, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 25, 26, 27, 31, 32, 33, 34, 35, 37, 39, 42, 44, 45, 50, 52, 55, 61, 62, 63, 65, 68, 75, 77, 78, 81, 82, 83, 84, 85, 87, 88, 92, 101, 103, 109A, 109B, 119, 120, 132, 135, 137B, 139, 141, 142, 146, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 160, 161, 162, 171, 173, 174, 176, 177, 182, 183)
Drugi
Adrenomedulin • Mirisni • Opsin (3, 4, 5, 1LW, 1MW, 1SW, RGR, RRH) • Proteazom-aktivirani (1, 2, 3, 4) • SREB (1, 2, 3)
Klasa B: Sekretinu slični
GPR (56, 64, 97, 98, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 123, 124, 125, 126, 128, 133, 143, 144, 155, 157)
Drugi
Klasa C: Metabotropni
glutamat / feromon
TAS1R (1, 2, 3) • TAS2R (1, 3, 4, 5, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 16, 19, 20, 30, 31, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 45, 46, 50)
Drugi
Klasa F:
Frizzled / Zaglađeni
Uvojiti
Frizzled (1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10)
Zaglađeni
B trdu: peptidi (nrpl/grfl/cytl/horl), receptori (lgic, enzr, gprc, igsr, intg, nrpr/grfr/cytr), itra (adap, gbpr, mapk), calc, lipd, signalni putevi (hedp, wntp, tgfp+mapp, notp, jakp, fsap, hipp, tlrp)