黃鼠冠狀病毒HKU24

黃鼠冠狀病毒HKU24
病毒分類 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
种:
黃鼠冠狀病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24

中國鼠冠狀病毒HKU24(China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24)是乙型冠狀病毒屬的一種病毒,在香港廣州大鼠腸道中被發現,於2015年由香港大學的研究人員發表[1]

基因組

中國鼠冠狀病毒HKU24的基因組約長31200nt,編碼冠狀病毒皆有的複製酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)與衣殼蛋白(N)等四種結構蛋白,另外還有血細胞凝集素酯酶英语Hemagglutinin esterase(HE)以及NS2a、NS4、NS5與N2等四種輔助蛋白,其基因順序為1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N[1]

演化

序列分析顯示中國鼠冠狀病毒HKU24在乙型冠狀病毒1型牛冠狀病毒人類冠狀病毒OC43豬凝血性腦脊髓炎病毒等)的基部形成一演化支,顯示此病毒可能是乙型冠狀病毒1型(包含兔冠狀病毒HKU14)的姊妹群,和同亞屬中亦感染鼠類的鼠冠狀病毒則關係較遠。此病毒的演化地位顯示可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型最早可能是由鼠類病毒演化而來。此病毒與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1等共同組成一演化支支序A(lineage A),此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶(HE),其他冠狀病毒則無[1][2]

參見

參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523可免费查阅. PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. (原始内容存档于2022-05-13) (英语). 
  2. ^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738可免费查阅. PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. (原始内容存档于2022-05-07) (英语). In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1). 
 
甲型冠狀病毒屬
(α-CoV)
甲型冠狀病毒1型
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒(FRECV · FRSCV) · 水鼬冠狀病毒(MCoV)
229E病毒
人類冠狀病毒229E(HCoV-229E) · 羊駝冠狀病毒(ACoV) · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
人類冠狀病毒NL63(HCoV-NL63) · NL63相關蝙蝠冠狀病毒英语NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b
長翼蝠冠狀病毒HKU8(Bat-CoV HKU8) · 長翼蝠冠狀病毒1型(Bat-CoV 1A/1B) · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33(Tr-BatCoV HKU33)
蝙蝠冠狀病毒HKU10(Bat-CoV HKU10) · 马铁菊头蝠甲型冠状病毒HuB-2013英语Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013 · 中華菊頭蝠冠狀病毒HKU32(Rs-BatCoV HKU32) · 蝙蝠冠狀病毒CDPHE15(BatCoV CDPHE15) · 高頭蝠冠狀病毒512(Sc-BatCoV-512) · 猪流行性腹泻病毒(PEDV)
其他
鼩鼱冠狀病毒T14(Sa-CoV T14) · 文成鼩鼱病毒(WESV) · 鹿城褐家鼠冠状病毒(LRNV)
乙型冠狀病毒屬
(β-CoV)
Embecovirus英语Embecovirus
(支系A)
乙型冠狀病毒1型(β1CoV)
牛冠狀病毒(BCoV) · 人類冠狀病毒OC43(HCoV-OC43) · 馬冠狀病毒(ECoV) · 豬凝血性腦脊髓炎病毒(PHEV) · 犬呼吸道冠狀病毒(CRCoV)
兔冠狀病毒HKU14(RbCoV HKU14) · 黃鼠冠狀病毒HKU24(ChRCoV HKU24) · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒(LAMV)
鼠冠狀病毒(M-CoV)
鼠肝炎病毒(MHV) · 大鼠冠狀病毒(RCoV)(大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV)
人類冠狀病毒HKU1(HCoV-HKU1) · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒(LRLV)
Merbecovirus英语Merbecovirus
(支系C)
刺蝟冠狀病毒(EriCoV) · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31(Ea-HedCoV HKU31) · 扁颅蝠冠状病毒HKU4(Bat-CoV HKU4) · 伏翼蝠冠状病毒HKU5(Bat-CoV HKU5) · 中東呼吸綜合症冠狀病毒(MERS-CoV) · 祖魯棕蝠冠狀病毒(NeoCoV) · 灰伏翼冠狀病毒HKU25(Hp-BatCoV HKU25)
Nobecovirus英语Nobecovirus(支系D)
果蝠冠状病毒GCCDC1(Ro-BatCoV GCCDC1) · 果蝠冠状病毒HKU9(Ro-BatCoV HKU9)
Hibecovirus英语Hibecovirus                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013(BtHp-BetaCoV/ZJ2013)
Sarbecovirus(支系B)                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV(詳见Template:SARSr-CoV)
丙型冠状病毒属
(γ-CoV)
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒(白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22)
Brangacovirus英语Brangacovirus
Igacovirus英语Igacovirus
禽冠狀病毒(傳染性支氣管炎病毒) · 禽冠狀病毒9203(火雞冠狀病毒)
丁型冠狀病毒屬
(δ-CoV)
鵯冠狀病毒HKU11(BuCoV HKU11) · 鶇冠狀病毒HKU12(ThCoV HKU12) · 文鳥冠狀病毒HKU13英语Munia coronavirus HKU13(MuCoV HKU13) · 猪丁型冠状病毒(PdCV) · 繡眼冠狀病毒HKU16英语White-eye coronavirus HKU16(WeCoV HKU16) · 麻雀冠狀病毒HKU17(SpCoV HKU17) · 鵲鴝冠狀病毒HKU18(MRCoV HKU18) · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20(WiCoV HKU20) · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21英语Common moorhen coronavirus HKU21(CMCoV HKU21) · 隼冠狀病毒HKU27(FalCoV UAE-HKU27) · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28(HouCoV UAE-HKU28) · 鴿冠狀病毒HKU29(PiCoV UAE-HKU29) · 鵪鶉冠狀病毒HKU30(QuaCoV UAE-HKU30)
 
分類單元識別碼