METTL16

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2H00

Ідентифікатори

Символи

METTL16, METT10D, methyltransferase like 16, methyltransferase 16, N6-methyladenosine

Зовнішні ІД

MGI: 1914743 HomoloGene: 34653 GeneCards: METTL16

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • 23S rRNA (adenine(1618)-N(6))-methyltransferase activity • mRNA (2'-O-methyladenosine-N6-)-methyltransferase activity • U6 snRNA 3'-end binding • RNA stem-loop binding • U6 snRNA (adenine-(43)-N(6))-methyltransferase activity • RNA binding • mRNA (N6-adenosine)-methyltransferase activity
Клітинна компонента	• клітинне ядро
Біологічний процес	• rRNA base methylation • Метилювання • posttranscriptional regulation of gene expression • mRNA methylation • snRNA (adenine-N6)-methylation • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • RNA methylation • mRNA catabolic process • S-adenosylmethionine biosynthetic process • mRNA destabilization
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


79066


67493

Ensembl


ENSG00000127804


ENSMUSG00000010554

UniProt


Q86W50


Q9CQG2

RefSeq (мРНК)


NM_024086


NM_026197

RefSeq (білок)


NP_076991


NP_080473

Локус (UCSC)

Хр. 17: 2.41 – 2.51 Mb

Хр. 11: 74.66 – 74.72 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

METTL16 (англ. Methyltransferase like 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 562 амінокислот, а молекулярна маса — 63 621^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MALSKSMHAR	NRYKDKPPDF	AYLASKYPDF	KQHVQINLNG	RVSLNFKDPE
AVRALTCTLL	REDFGLSIDI	PLERLIPTVP	LRLNYIHWVE	DLIGHQDSDK
STLRRGIDIG	TGASCIYPLL	GATLNGWYFL	ATEVDDMCFN	YAKKNVEQNN
LSDLIKVVKV	PQKTLLMDAL	KEESEIIYDF	CMCNPPFFAN	QLEAKGVNSR
NPRRPPPSSV	NTGGITEIMA	EGGELEFVKR	IIHDSLQLKK	RLRWYSCMLG
KKCSLAPLKE	ELRIQGVPKV	TYTEFCQGRT	MRWALAWSFY	DDVTVPSPPS
KRRKLEKPRK	PITFVVLASV	MKELSLKASP	LRSETAEGIV	VVTTWIEKIL
TDLKVQHKRV	PCGKEEVSLF	LTAIENSWIH	LRRKKRERVR	QLREVPRAPE
DVIQALEEKK	PTPKESGNSQ	ELARGPQERT	PCGPALREGE	AAAVEGPCPS
QESLSQEENP	EPTEDERSEE	KGGVEVLESC	QGSSNGAQDQ	EASEQFGSPV
AERGKRLPGV	AGQYLFKCLI	NVKKEVDDAL	VEMHWVEGQN	RDLMNQLCTY
IRNQIFRLVA	VN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Brown J.A., Kinzig C.G., DeGregorio S.J., Steitz J.A. (2016). Methyltransferase-like protein 16 binds the 3'-terminal triple helix of MALAT1 long noncoding RNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 113: 14013—14018. PMID 27872311 DOI:10.1073/pnas.1614759113

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:28484 (англ.) . Архів оригіналу за 13 жовтня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86W50 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 21 вересня 2017.