CDKN2A

CDKN2A
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

2A5E, 1A5E, 1BI7, 1DC2,%%s1A5E, 1BI7, 1DC2, 2A5E

Ідентифікатори
Символи CDKN2A, CDK4I, CDKN2, CMM2, INK4, INK4A, MLM, MTS-1, MTS1, P14, P14ARF, P16, P16-INK4A, P16INK4, P16INK4A, P19, P19ARF, TP16, cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, cyclin dependent kinase inhibitor 2A, Genes, p16, ARF.
Зовнішні ІД OMIM: 600160 MGI: 104738 HomoloGene: 55430 GeneCards: CDKN2A
Пов'язані генетичні захворювання
melanoma-pancreatic cancer syndrome, mucosal melanoma, меланома, familial atypical multiple mole melanoma syndrome[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

NF-kappaB binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity
protein kinase binding
RNA binding
DNA binding
p53 binding
transcription factor binding
MDM2/MDM4 family protein binding
ubiquitin-protein transferase inhibitor activity
SUMO transferase activity
disordered domain specific binding
GO:0090645, GO:0061637 ubiquitin ligase inhibitor activity

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
senescence-associated heterochromatin focus
клітинне ядро
ядерні тільця
нуклеоплазма
ядерце
мітохондрія
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process
negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity
replicative senescence
G1 phase
negative regulation of cell-matrix adhesion
клітинне старіння
negative regulation of cell growth
positive regulation of cellular senescence
positive regulation of macrophage apoptotic process
клітинний цикл
Ras protein signal transduction
negative regulation of phosphorylation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity
negative regulation of cell population proliferation
G1/S transition of mitotic cell cycle
GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle
GO:0097285 апоптоз
regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of protein stability
negative regulation of immature T cell proliferation in thymus
regulation of protein export from nucleus
negative regulation of protein kinase activity
negative regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process
protein K63-linked ubiquitination
positive regulation of signal transduction by p53 class mediator
somatic stem cell division
protein stabilization
protein polyubiquitination
positive regulation of protein sumoylation
transcription, DNA-templated
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
autophagy of mitochondrion
apoptotic mitochondrial changes
regulation of protein targeting to mitochondrion
protein destabilization
negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity
positive regulation of apoptotic process
rRNA processing
negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process
mitochondrial depolarization
positive regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
negative regulation of B cell proliferation
activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
regulation of apoptotic DNA fragmentation
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
positive regulation of protein localization to nucleus
protein sumoylation
GO:1901313 positive regulation of gene expression
GO:0060564, GO:1904190 negative regulation of ubiquitin protein ligase activity
amyloid fibril formation
negative regulation of protein neddylation

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1029
12578
Ensembl
ENSG00000147889
ENSMUSG00000044303
UniProt
P42771
Q8N726
P51480
Q64364
RefSeq (мРНК)
NM_000077
NM_001195132
NM_058195
NM_058196
NM_058197
NM_001363763
NM_001040654
NM_009877
RefSeq (білок)
NP_000068
NP_001182061
NP_478102
NP_478104
NP_001350692
NP_478102.2
NP_001035744
NP_034007
NP_034007.1
Локус (UCSC) Хр. 9: 21.97 – 22 Mb Хр. 4: 89.19 – 89.21 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDKN2A (англ. Cyclin dependent kinase inhibitor 2A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 16 533[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEPAAGSSMEPSADWLATAAARGRVEEVRALLEAGALPNAPNSYGRRPIQ
VMMMGSARVAELLLLHGAEPNCADPATLTRPVHDAAREGFLDTLVVLHRA
GARLDVRDAWGRLPVDLAEELGHRDVARYLRAAAGGTRGSNHARIDAAEG
PSDIPD

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

  • Serrano M., Hannon G.J., Beach D. (1993). A new regulatory motif in cell-cycle control causing specific inhibition of cyclin D/CDK4. Nature. 366: 704—707. PMID 8259215 DOI:10.1038/366704a0
  • Robertson K.D., Jones P.A. (1999). Tissue-specific alternative splicing in the human INK4a/ARF cell cycle regulatory locus. Oncogene. 18: 3810—3820. PMID 10445844 DOI:10.1038/sj.onc.1202737
  • Gump J., Stokoe D., McCormick F. (2003). Phosphorylation of p16INK4A correlates with Cdk4 association. J. Biol. Chem. 278: 6619—6622. PMID 12529334 DOI:10.1074/jbc.C200622200
  • Russo A.A., Tong L., Lee J.O., Jeffrey P.D., Pavletich N.P. (1998). Structural basis for inhibition of the cyclin-dependent kinase Cdk6 by the tumour suppressor p16INK4a. Nature. 395: 237—243. PMID 9751050 DOI:10.1038/26155
  • Yuan C., Li J., Selby T.L., Byeon I.-J., Tsai M.-D. (1999). Tumor suppressor INK4: comparisons of conformational properties between p16(INK4A) and p18(INK4C). J. Mol. Biol. 294: 201—211. PMID 10556039 DOI:10.1006/jmbi.1999.3231
  • Yuan C., Selby T.L., Li J., Byeon I.J., Tsai M.D. (2000). Tumor suppressor INK4: refinement of p16INK4A structure and determination of p15INK4B structure by comparative modeling and NMR data. Protein Sci. 9: 1120—1128. PMID 10892805 DOI:10.1110/ps.9.6.1120

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з CDKN2A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1787 (англ.) . Архів оригіналу за 16 березня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
  5. UniProt, P42771 (англ.) . Архів оригіналу за 13 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 9
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»