Haplogrupp
Inom molekylär evolution är en haplogrupp en grupp av liknande haplotyper, som delar en gemensam anfader med en enbaspolymorf (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) mutation. Ordet kommer från grekiskans ἁπλοῦς, haploûs, "enkel"[1]. Haplogrupper kan användas för att bestämma genetiska populationer; grupper av individer som hänger samman genetiskt. Haplogrupper används inom populationsgenetik och vid studiet av molekylär evolution.
På grund av att haplogrupper består av liknande haplotyper, går det att förutsäga en haplogrupp från haplotyper. Ett SNP-test bekräftar en haplogrupp. Olika haplogrupper tilldelas bokstäver i alfabetet för att klassificering, och finare bestämningar görs med siffer- och bokstavskombinationer till, exempel "R1b1". Haplogrupper från Y-kromosomen och mitokondrie-DNA (mtDNA) har olika haplogruppsbeteckningar. Haplogrupper är orsakade av djupa historiskt-genetiska förändringar som går tillbaka många tusentals år.[2]
I människans genetik, är Y-kromosomens haplogrupper och mitokondrie-DNA-haplogrupper de flitigast studerade. Både dessa kan användas för att bestämma genetiska populationer. Y-DNA ärvs endast längs den patrilinjära linjen (på fädernet), medan mtDNA endast ärvs på mödernet.
Klassificeringar av mänskliga haplogrupper av båda sorterna, har utvecklats snabbt under de senaste åren medan nya markörer har upptäckts, särskilt genom metoden Unique event polymorphism (UEPs).
Mänskliga haplogrupper i Y-kromosomens DNA
Mänskliga DNA-haplogrupper i Y-kromosomen betecknas med bokstäverna A till T, och delas därefter in med nummer och gemena bokstäver. Beteckningarna bestäms av Y Chromosome Consortium.[3]
| Mänskliga DNA-haplogrupper i Y-kromosomen (Lista över Y-DNA-haplogrupper) | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Y-kromosoms-Adam | |||||||||||||||||||||||||||||||
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||
| A | BT | ||||||||||||||||||||||||||||||
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||
| B | CT | ||||||||||||||||||||||||||||||
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CF | DE | ||||||||||||||||||||||||||||||
| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||
| C | F | D | E | ||||||||||||||||||||||||||||
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||
| G | H | IJK | |||||||||||||||||||||||||||||
| | | |||||||||||||||||||||||||||||||
| IJ | K | ||||||||||||||||||||||||||||||
| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||
| I | J | L | M | NO | P | S | T | ||||||||||||||||||||||||
| | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||
| N | O | Q | R | ||||||||||||||||||||||||||||
Mänskliga haplogrupper i mitokondrie-DNA
Människans mtDNA-haplogrupper betecknas med följande bokstäver:
A, B, C, CZ, D, E, F, G, H, HV, I, J, JT, K, L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, L7, M, N, O, P, Q, R, R0, R2'JT, S, T, U, V, W, X, Y, och Z.
| Människans haplogrupper (mt-DNA) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mitokondrie-Eva | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L0 | L1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CZ | D | E | G | Q | A | I | O | R | S | W | X | Y | |||||||||||||||||||||||||||
| C | Z | B | F | R0 | R2'JT | P | U | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| HV | JT | K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | V | J | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mitokondrie-Eva är det namn som forskarna har gett den kvinna som är den senaste gemensamma anmodern av alla levande människor.
Se även
- Population
- Mitokondrie-Eva
- Svenskar#Ursprung och genetik
- Y-kromosoms-Adam
| |||||||||||||||||
Referenser
- ^ ”haplo”. Nationalencyklopedin. http://www.ne.se/uppslagsverk/encyklopedi/l%C3%A5ng/haplo-. Läst 20 mars 2016.
- ^ The International Society of Genetic Genealogy see Haplogroup definition in DNA-NEWBIE GLOSSARY [1]
- ^ ”Y Chromosome Consortium”. Arkiverad från originalet den 16 januari 2017. https://web.archive.org/web/20170116195823/http://ycc.biosci.arizona.edu/.
Externa länkar
Allmänna
- World Families Network
Nyheter
- Dienekes' Anthropology Blog tar ofta upp nya forskningsrön.
Samtliga DNA haplogrupper
- https://web.archive.org/web/20040728005528/http://www.scs.uiuc.edu/~mcdonald/WorldHaplogroupsMaps.pdf
Y kromosomens DNA-haplogrupper
- Y Chromosome Consortium
- ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree 2006
- DNA Heritage's Y-haplogroup map
- Haplogroup Predictor
- The Y Chromosome Consortium (2002), A Nomenclature System for the Tree of Human Y-Chromosomal Binary Haplogroups, Genome Research, Vol. 12(2), 339-348, February 2002. (Detailed hierarchical chart has conversions from previous naming schemes)
- DNA Consulting's Conversion Chart for Male Haplogroups (PDF)
- Semino et al (2000), The Genetic Legacy of Paleolithic Homo sapiens sapiens in Extant Europeans, Science, Vol 290 (paper which introduced the "Eu" haplogroups).
Mitokondrie-DNA-haplogrupper
- Phylotree: mtDNA Tree
- Family Tree DNA: mtDNA Haplotree
- YFull: MTree
- graphical mtDNA haplogroup skeleton
- The Making of the African mtDNA Landscape
- Do the Four Clades of the mtDNA Haplogroup L2 Evolve at Different Rates?
