Beta ukosnica
Beta ukosnica (beta-traka, beta-beta jedinica) je jednostavni proteinski strukturni motiv koji se sastoji od dva beta lanca i koji nalikuje na ukosnicu. Ovaj motiv se sastoji od dva lanca koja su susedna u primarnoj strukturi, orijentisana u antiparalelnim smerovima (N-terminus jednog lanca je susedan sa C-terminusom drugog) i povezana kratkom petljom sa dve do pet aminokiselina. Beta ukosnica se javlja u izolaciji ili kao deo serije vodonično vezanih lanaca koje kolektivno formiraju beta ravan.
NMR istraživaja su pokazala da se beta ukosnice mogu formirati iz izolovanih kratkh peptida u vodenim rastvorima, iz čega proizilazi da ukosnice mogu da budu mesta nukleacije tokom savijanja proteina.[1]
Reference
- ↑ Blanco, F. J.; Rivas, G.; Serrano, L. (1994). „A short linear peptide that folds into a native stable beta-hairpin in aqueous solution”. Nat Struct Biol 1 (9): 584–590. DOI:10.1038/nsb0994-584. PMID 7634098.
- p
- r
- u
Sekundarna struktura proteina
Heliksi: α-heliks • 310 heliks • π-heliks • β-heliks • Poliprolinski heliks • Kolagenski heliks
Ispružena: β-ravan • Okret • Beta ukosnica • Beta izbočina • α-ravan
Supersekundarna: Upredena zavojnica • Heliks-okret-heliks • EF rukaFavorizuju heliks: Metionin • Alanin • Leucin • Glutaminska kiselina • Glutamin • Lizin
Favorizuju izdužene strukture: Treonin • Izoleucin • Valin • Fenilalanin • Tirozin • Triptofan
Favorizuju neuređene strukture: Glicin • Serin • Prolin • Asparagin • Asparaginska kiselina
Bez preferencije: Cistein • Histidin • Arginin
