IRF3

Регуляторный фактор интерферона 3
PDB в комплексе с 1j2f.PDB в комплексе с 1j2f.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 3QU6

Идентификаторы
Символ IRF3
Внешние ID OMIM: 603734 MGI: 1859179 HomoloGene: 1208 GeneCards: Ген IRF3
Функция • DNA binding

• sequence-specific DNA binding transcription factor activity
• transcription cofactor activity
• protein binding
• identical protein binding
• protein homodimerization activity

• transcription regulatory region DNA binding
Компонент клетки • nucleus

• nucleoplasm
• cytoplasm

• cytosol
Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

• toll-like receptor signaling pathway
• MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway
• transcription from RNA polymerase II promoter
• apoptotic process
• cellular response to DNA damage stimulus
• viral process
• cytokine-mediated signaling pathway
• lipopolysaccharide-mediated signaling pathway
• negative regulation of type I interferon production
• positive regulation of type I interferon production
• positive regulation of interferon-alpha production
• positive regulation of interferon-beta production
• toll-like receptor 3 signaling pathway
• toll-like receptor 4 signaling pathway
• TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway
• MDA-5 signaling pathway
• positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling
• response to exogenous dsRNA
• innate immune response
• type I interferon biosynthetic process
• negative regulation of interferon-beta biosynthetic process
• negative regulation of defense response to virus by host
• positive regulation of cytokine secretion
• defense response to virus
• interferon-gamma-mediated signaling pathway
• type I interferon signaling pathway
• positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway
• cellular response to dsRNA

• macrophage apoptotic process
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 3661 54131
Ensembl ENSG00000126456 ENSMUSG00000003184
UniProt Q14653 P70671
RefSeq (мРНК) NM_001197122 NM_016849
RefSeq (белок) NP_001184051 NP_058545
Локус (UCSC) Chr 19:
50.16 – 50.17 Mb		 Chr 7:
45 – 45 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Регуляторный фактор интерферона 3, известный также как IRF3 — один из регуляторных факторов интерферонов.[1]

Функция

IRF3 является членом семейства регуляторных факторов транскрипции (IRF) интерферонов.[1] IRF3 был первоначально обнаружен в гомологах IRF1 и IRF2. IRF3 был дополнительно охарактеризован и, как было выявлено, содержит несколько функциональных доменов, в том числе домен ядерного экспорта сигнала, ДНК-связывающий домен, ассоциацию с С-концевой областью МАФ и несколько регуляторных фосфорилированных сайтов.[2] IRF3 находится в неактивной цитоплазматической форме, при серин/ треонин-фосфорилировании образует комплекс с CREBBP[3] Этот комплекс транслоцируется в ядро и активирует транскрипцию интерферонов альфа и бета, а также других интерферон-индуцированной генов.[4]

IRF3 играет важную роль в системе врожденного иммунного отклика на вирусную инфекцию.[5] Были найдены агрегатированные MAVS[англ.], чтобы активировать димеризацию IRF3.[6]

Сигнальный путь толл-подобных рецепторов. Пунктирные серые линии представляют неизвестные ассоциации

Взаимодействия

IRF3 было показано, взаимодействуют с IRF7.[7]

См. также

Примечания

  1. ↑ 1 2 Hiscott J., Pitha P., Genin P., Nguyen H., Heylbroeck C., Mamane Y., Algarte M., Lin R. Triggering the interferon response: the role of IRF-3 transcription factor (англ.) // J. Interferon Cytokine Res. : journal. — 1999. — Vol. 19, no. 1. — P. 1—13. — doi:10.1089/107999099314360. — PMID 10048763.
  2. ↑ Lin R., Heylbroeck C., Genin P., Pitha P.M., Hiscott J. Essential Role of Interferon Regulatory Factor 3 in Direct Activation of RANTES Chemokine Transcription (англ.) // Mol Cell Biol[англ.] : journal. — 1999. — February (vol. 19, no. 2). — P. 959—966. — PMID 9891032. — PMC 116027.
  3. ↑ Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Control of IRF-3 activation by phosphorylation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 73—6. — doi:10.1089/107999002753452674. — PMID 11846977.
  4. ↑ Entrez Gene: IRF3 interferon regulatory factor 3  (неопр.).
  5. ↑ Collins S.E., Noyce R.S., Mossman K.L. Innate Cellular Response to Virus Particle Entry Requires IRF3 but Not Virus Replication (англ.) // J Virol[англ.] : journal. — 2004. — February (vol. 78, no. 4). — P. 1706—1717. — doi:10.1128/JVI.78.4.1706-1717.2004. — PMID 14747536. — PMC 369475.
  6. ↑ Hou F., Sun L., Zheng H., Skaug B., Jiang Q.X., Chen Z.J. MAVS Forms Functional Prion-Like Aggregates To Activate and Propagate Antiviral Innate Immune Response (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2011. — 5 August (vol. 146, no. 3). — P. 448—461. — doi:10.1016/j.cell.2011.06.041. — PMID 21782231. — PMC 3179916.
  7. ↑ Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — February (vol. 280, no. 2). — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.

Литература

  • Pitha P.M., Au W.C., Lowther W., Juang Y.T., Schafer S.L., Burysek L., Hiscott J., Moore P.A. Role of the interferon regulatory factors (IRFs) in virus-mediated signaling and regulation of cell growth (англ.) // Biochimie[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 80, no. 8—9. — P. 651—658. — doi:10.1016/S0300-9084(99)80018-2. — PMID 9865487.
  • Yoneyama M., Suhara W., Fujita T. Control of IRF-3 activation by phosphorylation (неопр.) // J. Interferon Cytokine Res.. — 2002. — Т. 22, № 1. — С. 73—6. — doi:10.1089/107999002753452674. — PMID 11846977.
  • Au W.C., Moore P.A., Lowther W., Juang Y.T., Pitha P.M. Identification of a member of the interferon regulatory factor family that binds to the interferon-stimulated response element and activates expression of interferon-induced genes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 92, no. 25. — P. 11657—11661. — doi:10.1073/pnas.92.25.11657. — PMID 8524823. — PMC 40461.
  • Yoneyama M., Suhara W., Fukuhara Y., Fukuda M., Nishida E., Fujita T. Direct triggering of the type I interferon system by virus infection: activation of a transcription factor complex containing IRF-3 and CBP/p300 (англ.) // EMBO J.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 17, no. 4. — P. 1087—1095. — doi:10.1093/emboj/17.4.1087. — PMID 9463386. — PMC 1170457.
  • Weaver B.K., Kumar K.P., Reich N.C. Interferon Regulatory Factor 3 and CREB-Binding Protein/p300 Are Subunits of Double-Stranded RNA-Activated Transcription Factor DRAF1 (англ.) // Mol. Cell. Biol.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 3. — P. 1359—1368. — PMID 9488451. — PMC 108849.
  • Lin R., Heylbroeck C., Pitha P.M., Hiscott J. Virus-Dependent Phosphorylation of the IRF-3 Transcription Factor Regulates Nuclear Translocation, Transactivation Potential, and Proteasome-Mediated Degradation (англ.) // Mol. Cell. Biol.[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 18, no. 5. — P. 2986—2996. — PMID 9566918. — PMC 110678.
  • Ronco L.V., Karpova A.Y., Vidal M., Howley P.M. Human papillomavirus 16 E6 oncoprotein binds to interferon regulatory factor-3 and inhibits its transcriptional activity (англ.) // Genes Dev. : journal. — 1998. — Vol. 12, no. 13. — P. 2061—2072. — doi:10.1101/gad.12.13.2061. — PMID 9649509. — PMC 316980.
  • Bellingham J., Gregory-Evans K., Gregory-Evans C.Y. Mapping of human interferon regulatory factor 3 (IRF3) to chromosome 19q13.3-13.4 by an intragenic polymorphic marker (англ.) // Annals of Human Genetics[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 62, no. Pt 3. — P. 231—234. — doi:10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x. — PMID 9803267.
  • Lowther W.J., Moore P.A., Carter K.C., Pitha P.M. Cloning and functional analysis of the human IRF-3 promoter (англ.) // DNA Cell Biol.[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 18, no. 9. — P. 685—692. — doi:10.1089/104454999314962. — PMID 10492399.
  • Kim T., Kim T.Y., Song Y.H., Min I.M., Yim J., Kim T.K. Activation of interferon regulatory factor 3 in response to DNA-damaging agents (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 43. — P. 30686—30689. — doi:10.1074/jbc.274.43.30686. — PMID 10521456.
  • Kumar K.P., McBride K.M., Weaver B.K., Dingwall C., Reich N.C. Regulated Nuclear-Cytoplasmic Localization of Interferon Regulatory Factor 3, a Subunit of Double-Stranded RNA-Activated Factor 1 (англ.) // Mol. Cell. Biol.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 20, no. 11. — P. 4159—4168. — doi:10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000. — PMID 10805757. — PMC 85785.
  • Suhara W., Yoneyama M., Iwamura T., Yoshimura S., Tamura K., Namiki H., Aimoto S., Fujita T. Analyses of virus-induced homomeric and heteromeric protein associations between IRF-3 and coactivator CBP/p300 (англ.) // J. Biochem.[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 128, no. 2. — P. 301—307. — doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753. — PMID 10920266.
  • Servant M.J., ten Oever B., LePage C., Conti L., Gessani S., Julkunen I., Lin R., Hiscott J. Identification of distinct signaling pathways leading to the phosphorylation of interferon regulatory factor 3 (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 1. — P. 355—363. — doi:10.1074/jbc.M007790200. — PMID 11035028.
  • Smith E.J., Marié I., Prakash A., García-Sastre A., Levy D.E. IRF3 and IRF7 phosphorylation in virus-infected cells does not require double-stranded RNA-dependent protein kinase R or Ikappa B kinase but is blocked by Vaccinia virus E3L protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 12. — P. 8951—8957. — doi:10.1074/jbc.M008717200. — PMID 11124948.
  • Au W.C., Yeow W.S., Pitha P.M. Analysis of functional domains of interferon regulatory factor 7 and its association with IRF-3 (англ.) // Virology : journal. — 2001. — Vol. 280, no. 2. — P. 273—282. — doi:10.1006/viro.2000.0782. — PMID 11162841.
  • Barnes B.J., Moore P.A., Pitha P.M. Virus-specific activation of a novel interferon regulatory factor, IRF-5, results in the induction of distinct interferon alpha genes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 26. — P. 23382—23390. — doi:10.1074/jbc.M101216200. — PMID 11303025.
  • Mach C.M., Hargrove B.W., Kunkel G.R. The Small RNA gene activator protein, SphI postoctamer homology-binding factor/selenocysteine tRNA gene transcription activating factor, stimulates transcription of the human interferon regulatory factor-3 gene (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 7. — P. 4853—4858. — doi:10.1074/jbc.M108308200. — PMID 11724783.
  • Morin P., Bragança J., Bandu M.T., Lin R., Hiscott J., Doly J., Civas A. Preferential binding sites for interferon regulatory factors 3 and 7 involved in interferon-A gene transcription (англ.) // J. Mol. Biol.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 316, no. 5. — P. 1009—1022. — doi:10.1006/jmbi.2001.5401. — PMID 11884139.
  • Dang O., Navarro L., Anderson K., David M. Cutting edge: anthrax lethal toxin inhibits activation of IFN-regulatory factor 3 by lipopolysaccharide (англ.) // J. Immunology : journal. — 2004. — Vol. 172, no. 2. — P. 747—751. — doi:10.4049/jimmunol.172.2.747. — PMID 14707042.