Lysozyme

Lysozyme
Lysozyme humain avec N-acétylglucosamine et mannose en vert (PDB 1REM[1])
Caractéristiques générales
Nom approuvé	Lysozyme
Symbole	LYZ
N° EC	3.2.1.17
Homo sapiens
Locus	12q15
Masse moléculaire	16 537 Da[2]
Nombre de résidus	148 acides aminés[2]
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
Entrez 4069 HUGO 6740 OMIM 153450 UniProt P61626 RefSeq (ARNm) NM_000239.2 RefSeq (protéine) NP_000230.1 Ensembl ENSG00000090382 PDB 133L, 134L, 1B5U, 1B5V, 1B5W, 1B5X, 1B5Y, 1B5Z, 1B7L, 1B7M, 1B7N, 1B7O, 1B7P, 1B7Q, 1B7R, 1B7S, 1BB3, 1BB4, 1BB5, 1C43, 1C45, 1C46, 1C7P, 1CJ6, 1CJ7, 1CJ8, 1CJ9, 1CKC, 1CKD, 1CKF, 1CKG, 1CKH, 1D6P, 1D6Q, 1DI3, 1DI4, 1DI5, 1EQ4, 1EQ5, 1EQE, 1GAY, 1GAZ, 1GB0, 1GB2, 1GB3, 1GB5, 1GB6, 1GB7, 1GB8, 1GB9, 1GBO, 1GBW, 1GBX, 1GBY, 1GBZ, 1GDW, 1GDX, 1GE0, 1GE1, 1GE2, 1GE3, 1GE4, 1GEV, 1GEZ, 1GF0, 1GF3, 1GF4, 1GF5, 1GF6, 1GF7, 1GF8, 1GF9, 1GFA, 1GFE, 1GFG, 1GFH, 1GFJ, 1GFK, 1GFR, 1GFT, 1GFU, 1GFV, 1HNL, 1I1Z, 1I20, 1I22, 1INU, 1IOC, 1IP1, 1IP2, 1IP3, 1IP4, 1IP5, 1IP6, 1IP7, 1IWT, 1IWU, 1IWV, 1IWW, 1IWX, 1IWY, 1IWZ, 1IX0, 1IY3, 1IY4, 1JKA, 1JKB, 1JKC, 1JKD, 1JSF, 1JWR, 1LAA, 1LHH, 1LHI, 1LHJ, 1LHK, 1LHL, 1LHM, 1LMT, 1LOZ, 1LYY, 1LZ1, 1LZ4, 1LZ5, 1LZ6, 1LZR, 1LZS, 1OP9, 1OUA, 1OUB, 1OUC, 1OUD, 1OUE, 1OUF, 1OUG, 1OUH, 1OUI, 1OUJ, 1QSW, 1RE2, 1REM, 1REX, 1REY, 1REZ, 1TAY, 1TBY, 1TCY, 1TDY, 1UBZ, 1W08, 1WQM, 1WQN, 1WQO, 1WQP, 1WQQ, 1WQR, 1YAM, 1YAN, 1YAO, 1YAP, 1YAQ, 207L, 208L, 2BQA, 2BQB, 2BQC, 2BQD, 2BQE, 2BQF, 2BQG, 2BQH, 2BQI, 2BQJ, 2BQK, 2BQL, 2BQM, 2BQN, 2BQO, 2HEA, 2HEB, 2HEC, 2HED, 2HEE, 2HEF, 2LHM, 2MEA, 2MEB, 2MEC, 2MED, 2MEE, 2MEF, 2MEG, 2MEH, 2MEI, 2NWD, 2ZIJ, 2ZIK, 2ZIL, 2ZWB, 3EBA, 3FE0, 3LHM, 3LN2, 4I0C, 4ML7, 4R0P GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
Lysozyme Like 1
Caractéristiques générales
Nom approuvé	Lysozyme Like 1
Symbole	LYZL1
N° EC	3.2.1.17
Homo sapiens
Locus	10p12.1
Masse moléculaire	16 654 Da[2]
Nombre de résidus	148 acides aminés[2]
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
Entrez 84569 HUGO 30502 UniProt Q6UWQ5 RefSeq (ARNm) NM_032517.4 RefSeq (protéine) NP_115906.3 Ensembl ENSG00000120563 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
Lysozyme Like 2
Caractéristiques générales
Nom approuvé	Lysozyme Like 2
Symbole	LYZL2
N° EC	3.2.1.17
Homo sapiens
Locus	10p11.23
Masse moléculaire	16 656 Da[2]
Nombre de résidus	148 acides aminés[2]
Liens accessibles depuis GeneCards et HUGO.
Entrez 119180 HUGO 29613 OMIM 612748 UniProt Q7Z4W2 RefSeq (ARNm) NM_183058.2 RefSeq (protéine) NP_898881.2 Ensembl ENSG00000151033 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Le lysozyme ou muramidase est une protéine globulaire longue d'une centaine d'acides aminés (130 chez l'être humain) qui est impliquée dans la défense contre les infections bactériennes. Elle est présente chez de nombreuses espèces d'animaux (vertébrés, insectes, acariens^[3] et certains mollusques). On le trouve en particulier dans un certain nombre de sécrétions (larmes, salive, lait maternel, mucus...) et dans le blanc d'œuf (129 acides aminés chez la poule).

Il s'agit d'une glycoside hydrolase acide (EC 3.2.1.17) sécrétée par les granulocytes et les monocytes. Elle détruit la paroi bactérienne des bactéries à Gram positif en catalysant l'hydrolyse des peptidoglycanes la constituant. Cette propriété a incité certains auteurs^[Qui ?] à la qualifier d'antibiotique corporel. De manière plus précise, le lysozyme est un des constituants de l'immunité innée.

Cette protéine a été découverte par Alexander Fleming en 1922.

Le lysozyme de blanc d'œuf (type-C) possède une saveur sucrée 200 fois plus intense que celle de la protéine édulcorante thaumatine (au seuil de perception)^[4].

Lysozyme

Structure tertiaire du lysozyme d'œuf de poule (PDB 132l)

Données clés

N° EC	EC 3.2.1.17
N° CAS	9001-63-2

Activité enzymatique

IUBMB	Entrée IUBMB
IntEnz	Vue IntEnz
BRENDA	Entrée BRENDA
KEGG	Entrée KEGG
MetaCyc	Voie métabolique
PRIAM	Profil
PDB	RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
GO	AmiGO / EGO

modifier

Lysozyme de type c / α-Lactalbumine

Lysozyme de colin de Virginie (PDB 1DKJ)

Domaine protéique

Pfam	PF00062
Clan Pfam	CL0037
InterPro	IPR001916
PROSITE	PDOC00716
SCOP	1e0g
SUPERFAMILY	1e0g
TCDB	9.B.41
CAZy	GH22
CDD	cd00119

Mode d'action

Le lysozyme peut agir comme une opsonine innée, ou comme une enzyme lytique capable de lyser des bactéries, en particulier celles à Gram positif, indépendamment de leur pouvoir pathogène. En revanche, les bactéries à Gram négatif sont généralement résistantes à cette enzyme grâce à la couche externe de lipopolysaccharides (LPS) qui les caractérise. Cette couche LPS couvre la paroi muréique (par exemple, une couche de peptidoglycanes) et la protège contre l'attaque par le lysozyme en empêchant l'accès de cette enzyme.

Le lysozyme sert d'opsonine non spécifique innée en se fixant à la surface bactérienne, réduisant ainsi la charge négative et facilitant la phagocytose de la bactérie avant que les opsonines du système acquis de l'immunité. En d'autres termes, le lysozyme facilite la phagocytose par les leucocytes.

Concernant la lyse bactérienne, l'enzyme attaque les peptidoglycanes constituant la paroi des bactéries (particulièrement les bactéries Gram positif). En effet, le lysozyme hydrolyse les liaisons covalentes (β1→4 glucosidique) entre l'acide N-acétyl-muramique et le 4^e atome de carbone du N-acétyl-glucosamine^[4]. La molécule de peptidoglycane se trouve associée avec le site de fixation de l'enzyme (binding site) situé dans un creux entre les deux domaines. Cela contraint la molécule de substrat à adopter la conformation de l'état de transition. Les acides aminés Glu 35 (acide glutamique, acide aminé numéro 35), et Asp 52 (acide aspartique, acide aminé numéro 52) se sont révélés être indispensables à l'activité enzymatique. La Glu 35 agit comme donneur de proton au pont glycosidique, clivant la liaison C-O du substrat, tandis que l'Asp 52 sert de nucléophile permettant la formation transitoire d'une enzyme glycosylée. Celle-ci réagit alors avec une molécule d'eau, donnant le produit final de l'hydrolyse et l'enzyme dans sa forme initiale.

Maladies liées au lysozyme

Une mutation sur le gène du lysozyme peut être à l'origine de l'accumulation de protéines amyloïdes dans certains tissus.

Utilisation diagnostique

Un taux accru de lysozyme dans le sang est souvent lié à une sarcoïdose. Des valeurs de 8 mg/L ou plus sont considérées comme élevées.

Références

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