CXCL13

CXCL13
Visualisation de la protéine Cristallisée CXCL13
Structures disponibles
PDBRecherche d'orthologue: PDBe RCSB
Identifiants PDB

4ZAI, 5CBA, 5CBE

Identifiants
AliasesCXCL13, Ligand 13 de la chimiokine, Chimiotactique des lymphocytes B, BLC, Chimiokine 1 attirant les cellules B, BCA-1
IDs externesOMIM: 605149 MGI: 1888499 HomoloGene: 48431 GeneCards: CXCL13
Position du gène (Homme)
Chromosome 4 humain
Chr.Chromosome 4 humain[1]
Chromosome 4 humain
Localisation génomique pour CXCL13
Localisation génomique pour CXCL13
Locus4q21.1Début77,511,753 bp[1]
Fin77,611,834 bp[1]
Position du gène (Souris)
Chromosome 5 (souris)
Chr.Chromosome 5 (souris)[2]
Chromosome 5 (souris)
Localisation génomique pour CXCL13
Localisation génomique pour CXCL13
Locus5|5 E3Début96,104,810 bp[2]
Fin96,108,927 bp[2]
Expression génétique
Bgee
HumainSouris (orthologue)
Fortement exprimé dans
  • rate

  • ganglion lymphatique

  • appendice iléo-cæcal

  • rectum

  • ligament alvéolo-dentaire

  • thymus

  • artère temporale superficielle

  • vésicule biliaire

  • pylore

  • gencive
Fortement exprimé dans
  • rate

  • glande submandibulaire

  • subcutaneous adipose tissue

  • Cellule de Paneth

  • tissu adipeux blanc

  • artère carotide externe

  • left colon

  • artère carotide interne

  • secondary oocyte

  • trachée
Plus de données d'expression de référence
BioGPS
n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire
  • receptor ligand activity
  • CCR10 chemokine receptor binding
  • cytokine activity
  • heparin binding
  • CXCR3 chemokine receptor binding
  • chemokine activity
  • protein heterodimerization activity
  • fibroblast growth factor binding
  • CXCR5 chemokine receptor binding
Composant cellulaire
  • région extracellulaire
  • milieu extracellulaire
Processus biologique
  • chemokine-mediated signaling pathway
  • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration
  • cell-cell signaling
  • germinal center formation
  • regulation of angiogenesis
  • chimiotaxie
  • endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor
  • regulation of humoral immune response
  • cell surface receptor signaling pathway
  • response to lipopolysaccharide
  • regulation of cell population proliferation
  • defense response to bacterium
  • negative regulation of endothelial cell chemotaxis to fibroblast growth factor
  • positive regulation of T cell chemotaxis
  • réponse immunitaire
  • réponse inflammatoire
  • inflammation chronique
  • réponse de défense
  • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
  • regulation of signaling receptor activity
  • G protein-coupled receptor signaling pathway
  • lymphocyte chemotaxis across high endothelial venule
  • positive regulation of integrin activation
  • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin
  • B cell chemotaxis
  • activation of GTPase activity
  • neutrophil chemotaxis
  • leukocyte chemotaxis
  • cellular response to lipopolysaccharide
Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
EspècesHommeSouris
Entrez

10563

55985

Ensembl

ENSG00000156234

ENSMUSG00000023078

UniProt

O43927

O55038

RefSeq (mRNA)

NM_006419
NM_001371558

NM_018866

RefSeq (protéine)

NP_006410
NP_001358487

NP_061354

Localisation (UCSC)Chr 4: 77.51 – 77.61 MbChr 5: 96.1 – 96.11 Mb
Publication PubMed[3][4]
Wikidata
Voir/Editer HumainVoir/Editer Souris

Le ligand 13 de la chimiokine (motif CXC) ou CXCL13, également connu sous le nom de chimiotactique des lymphocytes B (BLC) ou chimiokine 1 attirant les cellules B (BCA-1), est un ligand protéique qui, chez l'humain, est codé par le gène CXCL13[5],[6].

Fonction

CXCL13 est une petite chimiokine appartenant à la famille de chimiokine CXC. Comme ses autres noms le suggèrent, cette chimiokine est sélectivement chimiotactique pour les lymphocytes B appartenant à la fois aux sous-ensembles B-1 et B-2, et provoque ses effets en interagissant avec le récepteur de chimiokine CXCR5[5],[7]. CXCL13 et son récepteur CXCR5 contrôlent l'organisation des lymphocytes B dans les follicules des tissus lymphoïdes[8] et est fortement exprimé dans le foie, la rate, les ganglions lymphatiques et l'intestin des humains[5]. Le gène de CXCL13 est situé sur le chromosome humain 4 dans un groupe d'autres chimiokines CXC[6].

Dans les lymphocytes T, on pense que l'expression de CXCL13 reflète une origine du centre germinatif de la cellule T, en particulier un sous-ensemble de cellules T appelées cellules T auxiliaires B folliculaires (ou cellules TFH). Par conséquent, on pense que l'expression de CXCL13 dans les lymphomes à cellules T, tels que le lymphome à cellules T angio-immunoblastique, reflète une origine du centre germinatif des cellules T néoplasiques[9].

Références

  1. a b et c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000156234 - Ensembl, May 2017
  2. a b et c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023078 - Ensembl, May 2017
  3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
  5. a b et c Legler DF, Loetscher M, Roos RS, Clark-Lewis I, Baggiolini M, Moser B, « B cell-attracting chemokine 1, a human CXC chemokine expressed in lymphoid tissues, selectively attracts B lymphocytes via BLR1/CXCR5 », J. Exp. Med., vol. 187, no 4,‎ , p. 655–60 (PMID 9463416, PMCID 2212150, DOI 10.1084/jem.187.4.655)
  6. a et b Gunn MD, Ngo VN, Ansel KM, Ekland EH, Cyster JG, Williams LT, « A B-cell-homing chemokine made in lymphoid follicles activates Burkitt's lymphoma receptor-1 », Nature, vol. 391, no 6669,‎ , p. 799–803 (PMID 9486651, DOI 10.1038/35876, S2CID 4373691)
  7. Ansel KM, Harris RB, Cyster JG, « CXCL13 is required for B1 cell homing, natural antibody production, and body cavity immunity », Immunity, vol. 16, no 1,‎ , p. 67–76 (PMID 11825566, DOI 10.1016/S1074-7613(01)00257-6 Accès libre)
  8. Ansel KM, Ngo VN, Hyman PL, Luther SA, Förster R, Sedgwick JD, Browning JL, Lipp M, Cyster JG, « A chemokine-driven positive feedback loop organizes lymphoid follicles », Nature, vol. 406, no 6793,‎ , p. 309–14 (PMID 10917533, DOI 10.1038/35018581, S2CID 4369622)
  9. de Leval L, Rickman DS, Thielen C, Reynies A, Huang YL, Delsol G, Lamant L, Leroy K, Brière J, Molina T, Berger F, Gisselbrecht C, Xerri L, Gaulard P, « The gene expression profile of nodal peripheral T-cell lymphoma demonstrates a molecular link between angioimmunoblastic T-cell lymphoma (AITL) and follicular helper T (TFH) cells », Blood, vol. 109, no 11,‎ , p. 4952–63 (PMID 17284527, DOI 10.1182/blood-2006-10-055145 Accès libre)
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