TARBP2

TARBP2
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2CPN, 3ADL, 3LLH, 4WYQ

معرفات
أسماء بديلة TARBP2, LOQS, TRBP, TRBP1, TRBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, subunit of RISC loading complex
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 605053 MGI: MGI:103027 HomoloGene: 7562 GeneCards: 6895
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• protein N-terminus binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• siRNA binding
• RNA binding
• enzyme binding
• pre-mRNA binding
• double-stranded RNA binding
• identical protein binding
• protein homodimerization activity
• pre-miRNA binding
• miRNA binding

مكونات خلوية

• سيتوبلازم
• عصارة خلوية
• perinuclear region of cytoplasm
• نواة
• بلازم نووي
• نقاط نووية
• RISC-loading complex
• مركب إسكات مستحث بالرنا

عمليات حيوية

• regulation of viral transcription
• negative regulation of protein kinase activity
• multicellular organism growth
• positive regulation of translation
• single fertilization
• negative regulation of defense response to virus by host
• spermatid development
• positive regulation of viral genome replication
• regulation of translation
• production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
• ‏GO:0061715 miRNA metabolic process
• إسكات الجين
• ‏GO:0070919 production of siRNA involved in RNA interference
• pre-miRNA processing
• regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
• skeletal muscle tissue regeneration
• positive regulation of muscle cell differentiation
• neural precursor cell proliferation

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 6895 21357
Ensembl ENSG00000139546 ENSMUSG00000023051
يونيبروت

Q15633

P97473

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_134323، ‏NM_134324، ‏XM_005269115، ‏XM_011538712، ‏XM_017019911، ‏XM_047429485 NM_004178، ‏NM_134323، ‏NM_134324، ‏XM_005269115، ‏XM_011538712، ‏XM_017019911، ‏XM_047429485

‏NM_009319، ‏XM_006520719، ‏XM_006520720، ‏XM_006520721، ‏XM_006520723، ‏XM_006520724، ‏XM_030248453، ‏XM_030248454، ‏XM_036159300، ‏XM_036159301، ‏XM_036159302، ‏XM_036159303، ‏XM_036159304، ‏XM_036159305 NM_001253795، ‏NM_009319، ‏XM_006520719، ‏XM_006520720، ‏XM_006520721، ‏XM_006520723، ‏XM_006520724، ‏XM_030248453، ‏XM_030248454، ‏XM_036159300، ‏XM_036159301، ‏XM_036159302، ‏XM_036159303، ‏XM_036159304، ‏XM_036159305

RefSeq (بروتين)

‏NP_599150، ‏NP_599151، ‏XP_005269171، ‏XP_005269172، ‏XP_005269174، ‏XP_005269177، ‏XP_005269179، ‏XP_006719644، ‏XP_011537014، ‏XP_016875399، ‏XP_016875400 NP_004169، ‏NP_599150، ‏NP_599151، ‏XP_005269171، ‏XP_005269172، ‏XP_005269174، ‏XP_005269177، ‏XP_005269179، ‏XP_006719644، ‏XP_011537014، ‏XP_016875399، ‏XP_016875400

‏NP_033345، ‏XP_006520782، ‏XP_006520783، ‏XP_006520784، ‏XP_006520786، ‏XP_006520787، ‏XP_030104313، ‏XP_030104314، ‏XP_036015193، ‏XP_036015194، ‏XP_036015195، ‏XP_036015196، ‏XP_036015197، ‏XP_036015198 NP_001240724، ‏NP_033345، ‏XP_006520782، ‏XP_006520783، ‏XP_006520784، ‏XP_006520786، ‏XP_006520787، ‏XP_030104313، ‏XP_030104314، ‏XP_036015193، ‏XP_036015194، ‏XP_036015195، ‏XP_036015196، ‏XP_036015197، ‏XP_036015198

الموقع (UCSC n/a Chr 15: 102.43 – 102.43 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

TARBP2‏ (TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين TARBP2 في الإنسان.[1][2]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Gatignol A، Buckler-White A، Berkhout B، Jeang KT (مارس 1991). "Characterization of a human TAR RNA-binding protein that activates the HIV-1 LTR". Science. ج. 251 ع. 5001: 1597–600. DOI:10.1126/science.2011739. PMID:2011739.
  2. ^ "Entrez Gene: TARBP2 Tar (HIV-1) RNA binding protein 2". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

  • Cosentino GP، Venkatesan S، Serluca FC، Green SR، Mathews MB، Sonenberg N (أكتوبر 1995). "Double-stranded-RNA-dependent protein kinase and TAR RNA-binding protein form homo- and heterodimers in vivo". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 92 ع. 21: 9445–9. DOI:10.1073/pnas.92.21.9445. PMC:40818. PMID:7568151.
  • Kozak CA، Gatignol A، Graham K، Jeang KT، McBride OW (يناير 1995). "Genetic mapping in human and mouse of the locus encoding TRBP, a protein that binds the TAR region of the human immunodeficiency virus (HIV-1)". Genomics. ج. 25 ع. 1: 66–72. DOI:10.1016/0888-7543(95)80110-8. PMID:7774957.
  • Gatignol A، Buckler C، Jeang KT (أبريل 1993). "Relatedness of an RNA-binding motif in human immunodeficiency virus type 1 TAR RNA-binding protein TRBP to human P1/dsI kinase and Drosophila staufen". Molecular and Cellular Biology. ج. 13 ع. 4: 2193–202. DOI:10.1128/mcb.13.4.2193. PMC:359540. PMID:8455607.
  • Gatignol A، Duarte M، Daviet L، Chang YN، Jeang KT (1996). "Sequential steps in Tat trans-activation of HIV-1 mediated through cellular DNA, RNA, and protein binding factors". Gene Expression. ج. 5 ع. 4–5: 217–28. PMID:8723388.
  • Kasof GM، Goyal L، White E (يونيو 1999). "Btf, a novel death-promoting transcriptional repressor that interacts with Bcl-2-related proteins". Molecular and Cellular Biology. ج. 19 ع. 6: 4390–404. DOI:10.1128/mcb.19.6.4390. PMC:104398. PMID:10330179.
  • Daviet L، Erard M، Dorin D، Duarte M، Vaquero C، Gatignol A (أبريل 2000). "Analysis of a binding difference between the two dsRNA-binding domains in TRBP reveals the modular function of a KR-helix motif". European Journal of Biochemistry / FEBS. ج. 267 ع. 8: 2419–31. DOI:10.1046/j.1432-1327.2000.01256.x. PMID:10759868.
  • Duarte M، Graham K، Daher A، Battisti PL، Bannwarth S، Segeral E، Jeang KT، Gatignol A (2001). "Characterization of TRBP1 and TRBP2. Stable stem-loop structure at the 5' end of TRBP2 mRNA resembles HIV-1 TAR and is not found in its processed pseudogene". Journal of Biomedical Science. ج. 7 ع. 6: 494–506. DOI:10.1007/bf02253365. PMID:11060498.
  • Siffroi JP، Pawlak A، Alfonsi MF، Troalen F، Guellaen G، Dadoune JP (مارس 2001). "Expression of the TAR RNA binding protein in human testis". Molecular Human Reproduction. ج. 7 ع. 3: 219–25. DOI:10.1093/molehr/7.3.219. PMID:11228241.
  • Daher A، Longuet M، Dorin D، Bois F، Segeral E، Bannwarth S، Battisti PL، Purcell DF، Benarous R، Vaquero C، Meurs EF، Gatignol A (سبتمبر 2001). "Two dimerization domains in the trans-activation response RNA-binding protein (TRBP) individually reverse the protein kinase R inhibition of HIV-1 long terminal repeat expression". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 36: 33899–905. DOI:10.1074/jbc.M103584200. PMID:11438532.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Iwasaki T، Chin WW، Ko L (سبتمبر 2001). "Identification and characterization of RRM-containing coactivator activator (CoAA) as TRBP-interacting protein, and its splice variant as a coactivator modulator (CoAM)". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 36: 33375–83. DOI:10.1074/jbc.M101517200. PMID:11443112.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Bannwarth S، Talakoub L، Letourneur F، Duarte M، Purcell DF، Hiscott J، Gatignol A (ديسمبر 2001). "Organization of the human tarbp2 gene reveals two promoters that are repressed in an astrocytic cell line". The Journal of Biological Chemistry. ج. 276 ع. 52: 48803–13. DOI:10.1074/jbc.M104645200. PMID:11641396.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Xu YC، Wu RF، Gu Y، Yang YS، Yang MC، Nwariaku FE، Terada LS (أغسطس 2002). "Involvement of TRAF4 in oxidative activation of c-Jun N-terminal kinase". The Journal of Biological Chemistry. ج. 277 ع. 31: 28051–7. DOI:10.1074/jbc.M202665200. PMID:12023963.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Battisti PL، Daher A، Bannwarth S، Voortman J، Peden KW، Hiscott J، Mouland AJ، Benarous R، Gatignol A (سبتمبر 2003). "Additive activity between the trans-activation response RNA-binding protein, TRBP2, and cyclin T1 on HIV type 1 expression and viral production in murine cells". AIDS Research and Human Retroviruses. ج. 19 ع. 9: 767–78. DOI:10.1089/088922203769232566. PMID:14585207.
  • Lee JY، Kim H، Ryu CH، Kim JY، Choi BH، Lim Y، Huh PW، Kim YH، Lee KH، Jun TY، Rha HK، Kang JK، Choi CR (يوليو 2004). "Merlin, a tumor suppressor, interacts with transactivation-responsive RNA-binding protein and inhibits its oncogenic activity". The Journal of Biological Chemistry. ج. 279 ع. 29: 30265–73. DOI:10.1074/jbc.M312083200. PMID:15123692.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  • Haase AD، Jaskiewicz L، Zhang H، Lainé S، Sack R، Gatignol A، Filipowicz W (أكتوبر 2005). "TRBP, a regulator of cellular PKR and HIV-1 virus expression, interacts with Dicer and functions in RNA silencing". EMBO Reports. ج. 6 ع. 10: 961–7. DOI:10.1038/sj.embor.7400509. PMC:1369185. PMID:16142218.
  • Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، Zhang LV، Wong SL، Franklin G، Li S، Albala JS، Lim J، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M (أكتوبر 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.
  • Bannwarth S، Lainé S، Daher A، Grandvaux N، Clerzius G، Leblanc AC، Hiscott J، Gatignol A (فبراير 2006). "Cell-specific regulation of TRBP1 promoter by NF-Y transcription factor in lymphocytes and astrocytes". Journal of Molecular Biology. ج. 355 ع. 5: 898–910. DOI:10.1016/j.jmb.2005.11.026. PMID:16343534.
  • Christensen HS، Daher A، Soye KJ، Frankel LB، Alexander MR، Lainé S، Bannwarth S، Ong CL، Chung SW، Campbell SM، Purcell DF، Gatignol A (مايو 2007). "Small interfering RNAs against the TAR RNA binding protein, TRBP, a Dicer cofactor, inhibit human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat expression and viral production". Journal of Virology. ج. 81 ع. 10: 5121–31. DOI:10.1128/JVI.01511-06. PMC:1900231. PMID:17360756.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 12
جينات الكروموسوم 12
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية